Cycle de webinaires "L’étude des socio-écosystèmes à large échelle: approches, défis et perspectives"

Du 27 mars 2026 au 24 juin 2026

Le projet structurant "large échelle" de la FR BioEEnViS lance un cycle de webinaire sur "L’étude des socio-écosystèmes à large échelle: approches, défis et perspectives".

Les objectifs des webinaires "Large échelle" sont de mettre en lien les différentes disciplines scientifiques en lien avec la FR BioEEnViS à travers les approches large-échelles, ainsi que d'alimenter une réflexion sur les bonnes pratiques pour l’étude des socio-écosystèmes à large échelle dans le cadre de la rédaction d’un article scientifique.

Fiche détaillée de présentation du webinaire

27 Mars 2026, 12h45-13h30

De la génétique de populations à la macrogénétique : illustration des problèmes inhérents à un changement d’échelle

Ivan Paz-Vinas (LEHNA, Lyon 1)

Les études macrogénétiques ont connu un développement rapide ces dernières années, en s’appuyant sur de vastes ensembles de données moléculaires disponibles en libre accès pour analyser la diversité génétique intraspécifique et ses déterminants (facteurs environnementaux, gradients géographiques, effets anthropogéniques…) à grande échelle, qu’elle soit spatiale, temporelle ou taxonomique. Portée par de multiples progrès en biologie évolutive, en biostatistique et en sciences des données, la macrogénétique permet non seulement d’aborder des questions évolutives fondamentales (ex. identifier les effets relatifs de l’environnement et ceux des traits d’histoire de vie sur la variation génétique) mais présente également un fort potentiel pour améliorer le suivi de la biodiversité et pour orienter les stratégies et les politiques de conservation. Malgré son caractère innovant, cette discipline émergente soulève quelques controverses, en raison de la généralisation parfois excessive de ses conclusions, ainsi que des défis associés aux analyses à grande échelle. Le passage de la génétique des populations à la macrogénétique s’avère en effet complexe et nécessite une grande rigueur méthodologique pour garantir des résultats fiables. Dans cette présentation, je donnerai un aperçu illustré par des exemples des principaux problèmes identifiés en lien avec ce changement d’échelle, ainsi que des recommandations méthodologiques pour améliorer la robustesse, l’applicabilité et la pertinence des analyses macrogénétiques.

07 mai 2026, 13h-13h45

La baignade en droit comparé

Victoria Chiu (EVS, Lyon 3)

Victoria Chiu, Maîtresse de conférence en droit public, Faculté de droit, Université Jean Moulin Lyon 3, EVS-Institut de droit de l'environnement, Directrice du master Risques et environnement à Lyon 3. Victoria Chiu est spécialisée en droit de l'eau et en droit comparé de l'eau.

À l'heure du réchauffement global, la pratique de la baignade dans les cours d'eau et dans les lacs est de plus en plus répandue, voire même revendiquée. Si pour l'heure, il n'existe pas de droit à la baignade, un droit de la baignade a été construit au fil des années. Aujourd'hui, le droit régit la baignade tant sous l'angle de la prévention des risques que sous l'angle de la responsabilité à engager en cas d'accident. Dans les États membres de l'Union européenne, on observe une certaine harmonisation des règles juridiques portant sur la baignade même si des différences subsistent sur ce sujet.

28 mai 2026 - 12h45-13h30

EMII : un outil interdisciplinaire d’intégration du signal atmosphérique du plomb à l’échelle pan-européenne pour reconstituer l’origine et la diffusion de la métallurgie depuis le Néolithique

Hugo Delile (Archéorient, CNRS)

Carottage dans la tourbière de la Digonnière (Massif du Pilat)
Crédit: H. Delile

Hugo Delile est chargé de recherche au CNRS et rattaché au laboratoire Archéorient (UMR 5133, Lyon). Ses travaux en géoarchéologie et géochimie environnementale portent sur la reconstruction des interactions sociétés–environnements à long terme, à travers l’étude du paléoanthropocène urbain et du métabolisme des villes. Il mobilise notamment les isotopes du plomb dans les archives environnementales au sein des différents compartiments constituant les surfaces continentales (tourbières, lacs, milieux fluviaux et fluvio-marins) pour retracer les dynamiques de circulation des métaux, leurs impacts environnementaux et sanitaires, ainsi que les héritages de ces pollutions dans les environnements contemporains. Ses travaux se déploient de part et d’autre de la Méditerranée, dans les régions orientales (Grèce, Turquie) et occidentales (France), ainsi qu’en Afrique du Nord (Maroc, Tunisie).

L’exploitation des métaux a profondément structuré les sociétés anciennes, façonné les réseaux d’échange et laissé une empreinte durable dans les environnements naturels. Elle s’est accompagnée d’émissions atmosphériques d’aérosols métalliques, transportés sur de longues distances avant d’être piégés dans des archives naturelles telles que les tourbières, les lacs ou les glaces. L’interprétation du signal atmosphérique du plomb enregistré dans ces archives soulève un débat central quant à son échelle d’expression spatiale. Alors que certains travaux privilégient une lecture locale ou régionale, d’autres proposent une intégration à des échelles macro-régionales à continentales selon la nature des archives et les approches disciplinaires concernées. Cette divergence limite la reconstitution, et donc notre compréhension, de la provenance des minerais plombo-argentifères et des dynamiques de diffusion de la métallurgie à larges échelles. L’Indice d’Intensité des Matchs Environnementaux (EMII) est ici introduit comme une réponse à ces limites. Cet outil, à l’interface entre les sciences environnementales et archéométriques, met en relation, via un traitement algorithmique, des bases de données environnementales et géologiques afin d’intégrer le signal atmosphérique du plomb à l’échelle pan-européenne. Appliquée aux données isotopiques disponibles pour les six derniers millénaires à l’échelle européenne, cette approche met en évidence une réorganisation majeure des réseaux métallurgiques entre la Protohistoire et les périodes historiques. Ces résultats offrent une lecture intégrée et multi-échelles des interactions entre sociétés et environnements et s’inscrivent dans une perspective de paléoanthropocène urbain, où production, circulation et consommation des métaux structurent durablement les dynamiques d’anthropisation depuis le Néolithique.

24 juin 2026 - 13h-13h45

L'arbre du vivant : visualisation et exploration d'une structure de grande échelle

Damien de Vienne (LBBE, CNRS)

Damien de Vienne est chargé de recherche au CNRS, rattaché au Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive (LBBE). Il est actuellement chercheur invité à Héraklion, en Crète, au sein de l'Institute of Computer Science (ICS) de la Foundation for Research and Technology Hellas (FORTH). Ses recherches portent sur l'étude des processus évolutifs à toutes les échelles, à travers l'analyse et la visualisation des patrons qui en résultent : les phylogénies. Il est l'auteur de l'outil Lifemap, dédié à la visualisation de l'arbre du vivant. Ses travaux récents s'intéressent aux liens entre transferts horizontaux de gènes et détection d'espèces inconnues.

L'arbre du vivant décrit l'ensemble des liens de parenté unissant tous les organismes vivants, éteints et actuels. De cet objet théorique nous ne connaissons qu'une petite partie : environ 3 millions d'espèces, représentant en grande majorité des organismes actuels mais aussi quelques fossiles. Cet arbre servira de fil conducteur à cette présentation. Dans une première partie, j'expliquerai le défi de visualiser un arbre de près de 3 millions de feuilles et les solutions que nous y avons apportées avec le logiciel Lifemap. Dans une seconde partie, je me pencherai sur l'immensité invisible de cet arbre du vivant : je présenterai d'abord l'impact de la non-prise en compte de cette diversité inconnue sur de nombreuses études en biologie évolutive, avant de décrire nos recherches actuelles visant à révéler et quantifier cette part de diversité jusqu’alors jugée inaccessible