Projets émergents 2020

DetecDic

Amélioration des performances d’un biocapteur SPRI par ajout d’un module de transport actif et application à la détection de bactéries pathogènes du genre Dickeya

Résumé: Le projet DetecDic associant les laboratoires MAP et Ampère vise à mettre au point un biocapteur à résonance plasmonique de surface (biocapteur SPR) optimisé pour la détection de bactéries phytopathogènes du genre Dickeya. L’une des originalités de l’approche proposée repose sur l’intégration d’une fonction d’actuation électrocinétique au capteur développé. Les bactéries pourront être collectées de manière efficace à la surface du capteur grâce à l’application d’un champ électrique permettant le brassage électroosmotique de la solution et la migration des bactéries par diélectrophorèse. La surface du capteur (servant également de microélectrode pour produire le champ) sera fonctionnalisée avec des anticorps spécifiques de Dickeya.

© Marion Costella d'après M. Costella (2020)

GenoPic

Adaptations génomiques chez un microorganisme eucaryote algal clé dans le fonctionnement d’un écosystème lacustre extrême, Picocystis salinarum

Interaction Agrobacterium–Fallopia : quand deux constructeurs (de niche) se rencontrent ?

MitoPop

Caractérisation du fonctionnement mitochondrial par fluorescence et application aux populations animales en milieux naturel

PoMetS

Polymorphisme de stratégie, métabolisme et sénescence chez une espèce de poisson invasif, le gobie à taches noires

Résumé : Afin de caractériser les tactiques alternatives de reproduction dans un contexte d’invasion biologique, différents paramètres de reproduction, physiologiques et comportementaux seront étudiés chez une espèce invasive de poisson, le gobie à tâche noire (Neogobius melanostomus) qui commence à s’installer en France.

© Loïc Teulier

SymB

Visualiser le transfert de vitamines B entre la bactérie mutualiste et l’insecte hôte dans les symbioses nutritionnelles du charançon des céréales et de la punaise de lit

Résumé: Le charançon ravageur de céréales Sitophilus spp. et la punaise de lit Cimex lectularius vivent tous deux en symbiose nutritionnelle obligatoire avec des bactéries mutualistes qui leur fournissent des vitamines B. Le but de ce projet de microscopie corrélative est de déterminer comment la bactérie transfère les vitamines B à l’insecte. Connaitre ce(s) mécanisme(s) apportera une piste de développement pour le contrôle de ces insectes par rupture de la symbiose.

PGinSect

Le peptidoglycane bactérien et l’immunité innée

RNA seqDual

Développement du dual RNA-seq sur cellules isolées pour l’étude systémique des interactions symbiotiques : application chez les insectes d’intérêt agronomique

Résumé : Ce projet vise à développer une nouvelle stratégie de séquençage simultané du transcriptome de l’hôte et de ses symbiotes, à l’échelle de la cellule unique, en alliant les avantages du dual RNA-seq pour l’étude des interactions symbiotiques et le niveau de résolution du single-cell RNA-seq. Pouvoir analyser, à l’échelle de la cellule unique, le transcriptome des bactériocytes, ces cellules spécialisées dans l’hébergement des bactéries symbiotiques, permettra ainsi de répondre à des questions biologiques fondamentales autour de ces cellules et d'identifier potentiellement de nouvelles cibles pour la lutte contre les insectes ravageurs symbiotiques. Résumé : Ce projet vise à développer une nouvelle stratégie de séquençage simultané du transcriptome de l’hôte et de ses symbiotes, à l’échelle de la cellule unique, en alliant les avantages du dual RNA-seq pour l’étude des interactions symbiotiques et le niveau de résolution du single-cell RNA-seq. Pouvoir analyser, à l’échelle de la cellule unique, le transcriptome des bactériocytes, ces cellules spécialisées dans l’hébergement des bactéries symbiotiques, permettra ainsi de répondre à des questions biologiques fondamentales autour de ces cellules et d'identifier potentiellement de nouvelles cibles pour la lutte contre les insectes ravageurs symbiotiques.